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麋鹿中心在鹿类多器官差异基因表达分析方面取得新突破

颁布耗时:2026年0七月份05日 15:42

图1.梅花鹿和麋鹿肝脏差异基因表达火山图

图1.桂花鹿和麋鹿肝部差别的基因组展现火山图

图2.麋鹿和梅花鹿瘤胃差异表达基因聚类

图2.麋鹿和腊梅鹿瘤胃相互影响描述基因组聚类分析

图3.梅花鹿瘤胃和空胃差异表达基因聚类

图3.腊梅鹿瘤胃和空胃对比分析描述表观遗传聚类分析

图4.梅花鹿瘤胃和空肠差异表达基因聚类

图4.桂花鹿瘤胃和空肠之间的关系体现表观遗传聚类分析

麋鹿(Elaphurus davidianus)是中国特有的珍稀物种、国家一级重点保护动物,被IUCN 物种红色名录评为野外绝灭(EW)。作为湿地生态系统健康与否的重要指示物种,麋鹿的进化潜力和遗🌞传适应是研究的热点。由于麋鹿奠基者种群较小,历史上经历了严重的瓶颈效应,优良基因可能丧失较多,导致麋鹿感染疾病的概率꧒越来越大,大规模疾病爆发事件被多次报道,给麋鹿种群的健康繁衍带来很大的威胁,开展麋鹿等鹿类动物各器官转录组水平的研究,从微观途径深入挖掘麋鹿等珍稀濒危动物生长发育的遗传调控机制,将极大促进麋鹿保护遗传学的研究深度,有利于揭示物种濒危机制,为推动有效保存遗传种质资源提供科学依据。

北京麋鹿生态实验中心张树苗博士团队首次利用转录组测序技术(RNA-seq),对麋鹿的多类器官组织(脾、盲肠、瘤胃、鹿茸、胰腺、肌肉、肺、结肠、肾、血液、肝脏、空肠、回肠、十二指肠、胎衣、子宫、皱胃、睾丸)、梅花鹿(Cervus nippon)的器官组织(结肠、肝脏、瘤胃、空肠、盲肠、回肠),以及马鹿(Cervus elaphus)的血液样品,进行了转录组测序。通过4只麋鹿个体的38份器官组织样品、2只梅花鹿的12份器官组织样品和1只马鹿的1份血液样品,共获得转录组数据432G。团队经过转录组测序和基因功能注释比对,新发现基因6ཧ284个,同时将转录组数据与8个数据库比对和注释,最终获得相应数据库注释信息的基因数目15417ඣ个,分别为COG:380个;GO:2073个; Swiss-port:1042个;KEGG:3349个;KOG:1329个;Pfam:1389个;EggNOG:2914个;TrEMBL:2941个。

除此之外,技术团队依据对麋鹿、腊梅鹿、马鹿与众各个人体系统团队的之间的关系形容人类染色体深入分析,知道腊梅鹿空肠和瘤胃之间的关系形容人类染色体数比很高,为2874个;此外是腊梅鹿瘤胃和肝或其他排毒部位;轻柔的的为腊梅鹿盲肠和直肠,仅有89个之间的关系形容人类染色体,且多种鹿在雷同人体系统团队的人类染色体形容存在的之间的关系(图1、图2),相同的种鹿的与众各个人体系统团队间之间的关系形容人类染色体差別很高(图3、图4),这体现了了人体系统发展关于的最为关键的人类染色体和信息通道定了其性能特异形。此深入分析结果显示为论述麋鹿简述近缘动物群腊梅鹿和马鹿与众各个人体系统内人类染色体的形容摸式和之间的关系形容横向,诠释之间的关系形容人类染色体所主要的免役适用于性具极为重要价值。当前,该科技科研成果的研发培训精英创业团队已赢得配用新颖知识产权1项,注册发名知识产权1项,的研发科技科研成果在《野生植物植物学报》刊出。下一时段.,该精英创业团队将灵活运用几组学的方式,研发麋鹿的滋生成长、身理病检实用功能及适用生态环境的显性基因系统,以有助于各国麋鹿庇护行业的建康的发展。该的研发岗位到了北科院创新发展打造内容的支撑。


(张树苗/文 李夷平/图)
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